Hutan bakau atau juga sering disebut hutan Mangrove adalah hutan yang tumbuh di rawa-rawa atau pantai genangan air laut serta berair payau yang dipengaruhi pasang surut air laut. Hutan bakau sering dikenal sebagai hutan daerah rendah. Pohon bakau tumbuh dan berkembang biak di habitat genangan air berkadar garam tinggi, berlumpur, dengan tanah yang labil. Hutan bakau banyak ditumbuhi pula oleh tumbuhan yang bersifat khas. Pohon bakau mengalami daur penggenangan oleh pasang surut air laut sebanyak dua kali dalam sehari semalam. Indonesia memiliki hutan bakau terluas di dunia. Salah satunya di papua, terutama disekitar teluk Bintuni. Ada banyak jenis tumbuhan yang hidup dan tumbuh di hutan bakau.
Tumbuhan bakau tumbuh menyesuaikan diri dengan kondisi lingkungan, seperti tergenang, berkadar garam, lumpur tinggi, dan tanah labil. Menghadapi variasi-variasi kondisi lingkungan seperti ini, secara alami dapat menyebabkan terbentuknya zonasi vegetasi mangrove, yang biasanya berlapis-lapis mulai dari bagian terluar hingga ke pedalaman.
Jenis-jenis bakau Rhizophora biasanya tumbuh di bagian terluar hutan yang sering digempur ombak. Bakau Rhizophora apiculata dan rhizophora mucronata tumbuh di atas lumpur. Bakau rhizophora stylosa dan perepat tumbuh diatas pasir berlumpur. Pada bagian laut yang lebih tenang, hidup tumbuhan bakau jenis api-api hitam (avicennia alba) yaitu di zona terluar atau zona pionir.
Di bagian lebih dalam, yang masih tergenang pasang tinggi, biasanya dapat ditemui campuran bakau Rhizophora mucronata dengan jenis kendeka, kabou, dan lain-lain. Jenis bakau ini merupakan jenis yang mempunyai biji berkecambah. Adapun ditepi sungai, yang lebih tawar airnya, biasanya ditemui tumbuhan nipah dan Pidada.
Pada bagian yang kering di pedalaman hutan didapatkan tumbuhan nirih atau Xylocarpus spp, teruntum, dungun, dan kayu buta-buta. Pohon bakau yang tumbuh di hutan bakau beradaptasi dengan berbagai cara. Beradaptasi secara fisik, yaitu kebanyakan pohon bakau menumbuhkan organ khas untuk bertahan hidup. Seperti bentuk akar, daun, dan buahnya.
Pohon bakau terbiasa hidup ditempat basah dengan kadar garam tinggi. Pada umumnya, pohon bakau memiliki akar tunjang yang berpori. Pori pada tumbuhan bakau berfungsi untuk menyesuaikan hidup dari ganasnya gelombang dan tanah yang tergenang air dengan pasokan oksigen yang sedikit. Tetapi ada pula pohon bakau yang hidup dengan akar nafas, dan akar lutut.